高町奈葉(田村由香里 配音)是一位平凡的高中三年級學(xué)生,某日,在上學(xué)的路上,她同來自異世界米德其路達的尤諾(水橋香織 配音)相遇了。尤諾告訴奈葉,她正在尋找遺落人間的太古遺產(chǎn)“圣石之種”,這種珍貴的寶物蘊藏著巨大的能量,如果棄之不顧有可能在人間界造成巨大的破壞,接二連三的波折之后,奈葉成為了幫助尤諾回收種子的魔法少女,開始了一段充滿了危險和刺激的奇幻旅程。某日,一位名叫菲特(水樹奈奈 配音)的金發(fā)少女出現(xiàn)在了奈葉的面前,她和奈葉一樣同為回收種子的魔法少女,也就是說,她們的關(guān)系是競爭者。奈葉能夠打敗這樣一位強勁的對手嗎?對于菲特來說,溫柔而又努力的奈葉又是一種怎樣的存在呢?